No Laboratório de Bioquímica são realizados experimentos de biolixiviação ou biossolubilização de rochas fosfáticas provenientes de resíduos de processo e de jazidas de baixo teor de fósforo, empregando diferentes cepas de fungos coletadas, selecionadas e desenvolvidas pelo grupo de pesquisa e cepas bacterianas acidófilas em diferentes formas de biorreatores air-lift em fermentação submersa, bem como também é realizada a biossolubilização de rochas fosfáticas empregando efluentes com ácidos orgânicos provenientes de outros processos, tais como o efluente da fermentação para produção de biohidrogênio. Neste laboratório estão locadas as incubadoras rotativas (shakers) e as mesas agitadoras nas quais são realizados os processos de fermentação em frascos erlenmeyes de bancada, como por exemplo, produção de biossurfactantes utilizando glicerol e melaço de soja. Além das fermentações em escala de bancada também são realizados os experimentos de sinterização de membranas em altas temperaturas utilizando mufla e forno de alta temperatura.